Au delà de l'appui spécifique aux activités et personnes directement liées à l'économie agricole et agroalimentaire , à la forêt et aux ressources de la mer , le ministère accomplit de nombreuses missions qui concernent l'ensemble des consommateurs et citoyens français. Elles se caractérisent par une grande diversité et font appel à de nombreuses compétences :
- la sécurité et la qualité de l'alimentation
- la promotion et les échanges au sein de l'union européenne et à l'international
- la formation agricole et l'emploi en milieu rural
- le développement et l'aménagement des territoires ruraux
- la qualité et la disponibilité de l'eau
- la préservation l'environnement et la gestion des espaces naturels.